电子邮件数据库的演变反映了计算机和互联网领域更广泛的进步。最初，在 20 世纪 60 年代，电子消息传递的基本形式存在于单个计算机系统中，允许用户在共享目录中互相留言。网络电子邮件的真正起源于 1971 年，当时雷·汤姆林森 (Ray Tomlinson) 通过阿帕网 (ARPANET) 发送了第一封电子邮件，并引入了如今标志性的“@”符号来指示用户的系统地址。
早期的电子邮件系统主要基于文本，缺乏复杂的组织功能。随着 20 世纪 80 年代和 90 年代电子邮件使用量的增长，尤其是互联网和个人电脑的兴起，对更强大的数据库的需求变得日益明显。早期的电子邮件客户端通常以简单的 外汇电子邮件列表 文件格式存储消息，这使得搜索和组织变得繁琐。
20 世纪 90 年代末和 21 世纪初，出现了更先进的电子邮件数据库，它们通常与专用的电子邮件服务器软件集成。这些数据库支持文件夹、搜索功能和基本过滤等功能。 Hotmail 和 Yahoo Mail 等网络邮件服务的出现进一步将数据库层从最终用户中抽象出来，提供商管理着日益庞大和复杂的电子邮件数据库。
如今，现代电子邮件平台依赖于能够处理海量数据的复杂数据库系统，支持高级搜索、标记、线程、垃圾邮件过滤以及与其他应用程序集成等功能。基于云的电子邮件服务进一步扩展了基础架构，提供几乎无限的存储空间和增强的可靠性。随着人工智能和机器学习技术的进步，电子邮件数据库的组织和功能更加智能，这种变革仍在继续。